Całokształtem działalności PUP kieruje Dyrektor zgodnie z zasadą jednoosobowego kierownictwa oraz na podstawie pełnomocnictw i upoważnień udzielonych przez Starostę, Zarząd i Radę Powiatu Niżańskiego i ponosi za nią pełną odpowiedzialność.
Dyrektor wykonuje czynności w sprawach z zakresu prawa pracy w stosunku do pracowników PUP w rozumieniu przepisów Kodeksu pracy.
Dyrektor kieruje działalnością PUP przy pomocy swojego Zastępcy, Głównego Księgowego i kierowników komórek organizacyjnych.
W czasie nieobecności Dyrektora lub niemożności pełnienia przez niego obowiązków, zadania i kompetencje w zakresie kierowania PUP przejmuje Zastępca, a w razie nieobecności Zastępcy pisemnie upoważniony przez Dyrektora kierownik komórki organizacyjnej. Zakres zastępstwa obejmuje wszystkie zadania i kompetencje Dyrektora, z wyłączeniem spraw wymagających szczególnych upoważnień.
Dyrektorem Urzędu jest Piotr Rutyna
Zastępcą Dyrektora jest Agnieszka Łyda
Kierownicy komórek organizacyjnych
Agnieszka Łyda - p.o. Kierownika Działu Organizacyjno-Administracyjnego
Anna Flisek - Główny Księgowy
Dorota Jędrzejewska - Kierownik Centrum Aktywizacji Zawodowej
Edyta Łoszczyk - Kierownik Referatu Usług Rynku Pracy
Jolanta Chwalik - Kierownik Działu Ewidencji, Świadczeń i Informacji